Starf flokkstjóra felst í að hafa umsjón með og skipuleggja daglegt starf á sumarnámskeiðum í samvinnu við verkefnastjóra. Hann annast þátttöku, leiðsögn og skipulagningu á námskeiðinu fyrir börn á grunnskólaaldri. 

Flokkstjórar heyra undir verkefnastjóra sumarstarfsins, og hafa umsjón með leiðbeinendum sumarnámskeiða.